???item.export.label??? ???item.export.type.endnote??? ???item.export.type.bibtex???

Please use this identifier to cite or link to this item: http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/680
Tipo do documento: Dissertação
Título: Estudo do efeito da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos da epinefrina usando dinâmica molecular de Car-Parrinello
Autor: Vasconcelos Neto, Arsênio Pereira de 
Primeiro orientador: Camargo, Ademir João
Primeiro membro da banca: Camargo, Ademir João
Segundo membro da banca: Oliveira, Solemar Silva
Terceiro membro da banca: Gargano, Ricardo
Resumo: A epinefrina é uma amina pertencente ao grupo das catecolaminas que atua como hormônio circulante e neurotransmissor. Regula os batimentos cardíacos, a pressão arterial e o diâmetro dos vasos sanguíneos. É solúvel em água e em sistema biológico possui o grupo amina totalmente protonado. Como a interação de fármacos com a água é de fundamental importância no entendimento dos mecanismos de absorção, transporte e ação biológica, a presente dissertação teve como objetivo estudar os efeitos da estrutura de solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos e eletrônicos da epinefrina. A dinâmica da estrutura de hidratação foi estudada usando a dinâmica molecular de Car-Parrinello com o funcional de troca e correlação PBE. As funções de ondas foram expandidas em termos de ondas planas com energia de corte de 25 Ry, massa fictícia de 400 u.a e energia de corte de 100 Ry para a expansão da densidade de carga. As temperaturas dos sistemas estudados foram controladas usando o termostato de Nosé-Hoover em 300 k. Os resultados da simulação mostram que a solvatação aquosa altera os parâmetros geométricos da epinefrina expressivamente, especialmente os relacionados com os grupos hidrofílicos. Observa-se ainda a formação de várias pontes de hidrogênio entre a epinefrina e as moléculas de água e a protonação espontânea do nitrogênio da epinefrina pelos hidrogênios das moléculas de água.
Abstract: Epinephrine is an amine belonging to the cathecholamine group and acts as a circulating hormone and neurotransmitter. It regulates heart rate, blood vessel and air passage diameter. It’s water soluble and in a biological system has its amine group totally protonated. Given that the interaction between pharmaceuticals and water is fundamentally important for our understanding of the absorption, transportation and biological action; this dissertation aims to study the effects of the water solvation structure on epinephrine’s geometric and electronic parameters. The dynamic of the solvation structure was studied using the Car-Parrinello molecular dynamics with PBE exchange correlation functional. The wave functions were expanded in terms of plane waves with a cutoff energy of 25 Ry, 400 a.u. fictitious mass and a cutoff energy of 100 Ry for the charge density expansion. The studied system temperatures were controlled at 300 K using the Nosé-Hoover thermostat. The simulation results show that the water solvation significantly changes epinephrine’s geometric parameters, especially those related to the hydrophilic groups. Various hydrogen bonds were observed forming between the water molecules and epinephrine, and the spontaneous protonation of epinephrine’s nitrogen by the hydrogens from the water molecules was also seen.
Palavras-chave: Epinefrina
Car-Parrinello
Solvatação aquosa
Epinephrine
Car-Parrinello
Aqueous solvation
Área(s) do CNPq: CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Estadual de Goiás
Sigla da instituição: UEG
Departamento: UEG ::Coordenação de Mestrado Ciências Moleculares
Programa: Programa de Pós-Graduação Stricto sensu em Ciências Moleculares
Citação: VASCONCELOS NETO, A. P. Estudo do efeito da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos da epinefrina usando dinâmica molecular de Car-Parrinello. 2014. 89 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Moleculares) - Câmpus Central - Sede: Anápolis – CET, Universidade Estadual de Goiás, Anápolis-GO.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/680
Data de defesa: 29-Jan-2014
Appears in Collections:Mestrado em Ciências Moleculares

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Arsenio_Pereira_de_Vasconcelos.pdfDissertação_Mestrado_em_Ciências_Moleculares3,59 MBAdobe PDFDownload/Open Preview


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.