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Tipo do documento: Dissertação
Título: Estudo conformacional do ritonavir no vácuo e em meio aquoso usando dinâmica molecular de Car-Parrinello
Autor: Moraes e Silva, Alisson 
Primeiro orientador: Oliveira, Solemar Silva
Primeiro membro da banca: Oliveira, Solemar Silva
Segundo membro da banca: Camargo, Ademir João
Terceiro membro da banca: Fernandes, William Borges
Resumo: O ritonavir é um anti-retroviral de via oral, usado juntamente com outros medicamentos para tratar o HIV/AIDS. Muitas vezes doses desse medicamento são usadas paralelamente a outros inibidores da protease e também há relatos do uso de sua combinação com outras drogas para o combate à hepatite C. Foram relatadas diferentes formas polimórficas do ritonavir dois anos após o início de sua comercialização, quando as cápsulas começaram a apresentar problemas de dissolução, consequentemente menor biodisponibilidade. Análises de raios-X evidenciaram a formação de um polimorfo menos solúvel. Fenômenos relacionados à solubilidade e biodisponibilidade de fármacos estão intimamente ligados à estrutura química dos mesmos e esta à interação das moléculas com solventes, portanto, o objetivo principal desse trabalho é avaliar os efeitos da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos e eletrônicos do ritonavir utilizando como ferramenta a Dinâmica Molecular de Car-Parrinello. Os elétrons do caroço foram tratados através dos pseudopotenciais ultrasoft de Vanderbilt, e os elétrons de valência foram representados pelo conjunto de funções de base de ondas planas. A energia de corte (Ecut) adotada foi de 25 Ry e a energia de corte para a densidade de cargas (Ecutrho) adotada foi de 200 Ry. Foram controladas as temperaturas dos sistemas estudados utilizando o termostato de Nosé-Hoover em 300 k. Os resultados da simulação mostram que a hidratação induz a formação de várias pontes de hidrogênio entre os grupos hidrofílicos do ritonavir e as moléculas de água, houve também protonação de dois nitrogênios presentes no fármaco. A separação adiabática se manteve constante durante toda a simulação, garantindo que não houve trocas de energia entre o sistema iônico e eletrônico.
Abstract: Ritonavir is an oral antiretroviral, used together with other medicines to treat HIV / AIDS. Doses of this drug are used simultaneously with others protease inhibitors and there are also reports of the use of ritonavir with other drugs to prevent hepatitis C. They were reported different polymorphic forms of ritonavir two years after the beginning of the market, when the capsules started to show dissolution problems consequently to the lower bioavailability. X-ray analysis showed the formation of a less soluble polymorph. Phenomena related to solubility and bioavailability of drugs are closely linked to the chemical structure of the same and with the interaction of molecules with solvents, therefore, the main objective of this study is to evaluate the effects of aqueous solvation on the geometric and electronic parameters of ritonavir using as tool Molecular dynamics of Car-Parrinello. The cores of the electrons were treated through the pseudopotential ultrasoft Vanderbilt, and the valence electrons were represented by the set of plane waves basis functions. The power cut (Ecut) was adopted 25 Ry and cutting power to the charge density (Ecutrho) was adopted 200 Ry. The temperatures of the studied systems were controlled using NoséHoover thermostat at 300 K. The simulation results show that hydration induces to formation of several hydrogen bridges between ritonavir hydrophilic groups and water molecules, there were also protonation of two nitrogens present in the drug. The adiabatic separation remained constant during the simulation, ensuring that there was no exchange of energy between the ionic and electronic system.
Palavras-chave: Ritonavir
Dinâmica Molecular
Car-Parrinello
Hidratação
Ritonavir
Molecular dynamics
Car-Parrinello
Hydration
Área(s) do CNPq: CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Estadual de Goiás
Sigla da instituição: UEG
Departamento: UEG ::Coordenação de Mestrado Ciências Moleculares
Programa: Programa de Pós-Graduação Stricto sensu em Ciências Moleculares
Citação: SILVA, A. M. Estudo conformacional do ritonavir no vácuo e em meio aquoso usando dinâmica molecular de Car-Parrinello. 2016. 97 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Moleculares) - Câmpus Central - Sede: Anápolis - CET, Universidade Estadual de Goiás, Anápolis-GO.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/618
Data de defesa: 8-Jun-2016
Appears in Collections:Mestrado em Ciências Moleculares

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