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dc.creatorBarbosa, Wesley de Paula-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/5040765671638367por
dc.contributor.advisor1Camargo, Ademir João-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4703181040916099por
dc.contributor.referee1Oliveira, Solemar Silva-
dc.contributor.referee2Esteves, Cristiano de Siqueira-
dc.date.accessioned2020-03-31T16:07:39Z-
dc.date.issued2012-05-01-
dc.identifier.citationBARBOSA, Wesley de Paula. Estudo do efeito da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos da carbamazepina usando a dinâmica molecular de Car-parrinello. 2012. 76 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Moleculares) - Câmpus Central - Sede: Anápolis - CET, Universidade Estadual de Goiás, Anápolis.por
dc.identifier.urihttp://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/244-
dc.description.resumoA dinâmica molecular de Car-Parrinello usando ondas planas e pseudopotenciais de norma não conservada de Vanderbilt foi usada no estudo do efeito da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos da carbamazepina (cbz). Para a quantificação do efeito do processo de solvatação aquosa, foram calculadas duas trajetórias: uma em fase isolada e outra em fase aquosa. Essas trajetórias foram obtidas no ensemble NVT, com a temperatura controlada em 300K usando o termostato de Nosé-Hoover. Os resultados mostram que os parâmetros geométricos da cbz isolada e os parâmetros dos anéis benzênicos e piridínicos da fase solvatada concordam muito bem com os resultados experimentais de raios-x. Não se observa diferenças nos parâmetros geométricos dos anéis benzênicos e piridínico entre a fase isolada e solvatada, mostrando o caráter hidrofóbico dessa região molecular. Os resultados mostram diferenças significativas entre os parâmetros geométricos do grupo carbamil da fase solvatada quando comparada com a fase isolada. As alterações desses parâmetros se deve a formação de ligações de hidrogênio entre as moléculas de água do solvente e os átomos compreendidos no grupo carbamil. Em adição, foram determinados os tempos de residência médios e as funções de distribuição radial das moléculas de água nas esferas de solvatação centradas nos átomos de oxigênio, nitrogênio e hidrogênio do grupo carbamil. O coeficiente de difusão calculado com a Equação de Einstein usando a trajetória da dinâmica de Car-Parrinello mostra uma discordância com o valor experimental, devido ao tempo de simulação, como também o tipo de solvente utilizado por procedimento experimental.por
dc.description.abstractThe Car-Parrinello molecular dynamics using plane waves and non-conserved pseudopotential of Vanderbilt was applied to study the aqueous solvation effects on the geometric parameters of carbamazepine. In order to quantify the aqueous solvation effects, two simulation trajectories were carried out: one in isolated phase of carbamazepine and other in aqueous solvation phase. These trajectories were carried out on NVT ensemble, with temperature kept at 300K using the Nosé-Hoover thermostat. The results show that the geometric parameters of isolated carbamazepine and benzene and pyridine rings from solvated phase agree very well with the experimental results from x-ray. Did not observe geometric parameters difference in the benzene and pyridine rings between isolated and solvated phase, showing the hydrophobic character of this molecular region. The results show significant differences between the geometric parameters of carbamoyl group from isolated phase when compared to the solvated phase. The changes in these parameters are attributed to the formation of hydrogen bonds between the water molecules and the atoms comprised in the carbomoyl group. In addition, we determined the mean residence time and radial distribution functions of water molecules in the solvation spheres centered on oxygen, nitrogen and hydrogen atoms from carbamoyl group. The diffusion coefficient calculated with the Einstein equation using the trajectory of the Car-Parrinello dynamics shows a disagreement with the experimental value, due to simulation time, as well as the type of solvent used for the experimental procedure.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Sandra Barbosa (sandrabarbosa632@gmail.com) on 2020-03-31T16:01:11Z No. of bitstreams: 2 license.txt: 2145 bytes, checksum: c95cd6f9b71291b5bf5d457abee715a1 (MD5) Wesley_M_C_M.pdf: 2704395 bytes, checksum: fd04c4de1506b069c8b5a370ca58a1d7 (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Sandra Barbosa (sandrabarbosa632@gmail.com) on 2020-03-31T16:07:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license.txt: 2145 bytes, checksum: c95cd6f9b71291b5bf5d457abee715a1 (MD5) Wesley_M_C_M.pdf: 2704395 bytes, checksum: fd04c4de1506b069c8b5a370ca58a1d7 (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2020-03-31T16:07:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 2145 bytes, checksum: c95cd6f9b71291b5bf5d457abee715a1 (MD5) Wesley_M_C_M.pdf: 2704395 bytes, checksum: fd04c4de1506b069c8b5a370ca58a1d7 (MD5) Previous issue date: 2012-05-01eng
dc.formatapplication/pdf*
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Estadual de Goiáspor
dc.publisher.departmentUEG ::Coordenação de Mestrado Ciências Molecularespor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.initialsUEGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação Stricto sensu em Ciências Molecularespor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectCarbamazepinapor
dc.subjectDinâmica molecular de Car-Parrinelopor
dc.subjectSolvatação aquosapor
dc.subjectcarbamazepinepor
dc.subjectCar-Parrinelo molecular dynamicspor
dc.subjectAqueous solvationpor
dc.subject.cnpqCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICApor
dc.subject.cnpqQUIMICA::FISICO-QUIMICApor
dc.titleEstudo do efeito da solvatação aquosa sobre os parâmetros geométricos da carbamazepina usando a dinâmica molecular de Car-parrinellopor
dc.typeDissertaçãopor
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